Webinar Hakkında
Sunucu
Julien Y. Dutheil
Araştırmam, biyolojik evrimin mekanizmalarını moleküler düzeyde anlamayı amaçlamaktadır. Özellikle stokastik süreçler ve organizasyonel düzeylerin (“sistemler”) rolüyle ilgileniyorum. Araştırma grubum, popülasyon genomiği, yapısal biyoinformatik ve “omiks” verilerinin istatistiksel analizine uygulanan hesaplamalı ve deneysel yaklaşımları birleştirmektedir.
Özet
Popülasyonlardaki mutasyonların kaderi, taşıdıkları bireyin uyumluluğu üzerindeki etkilerine bağlıdır. Bu uyumluluk etkisi, sırayla, genomdaki mutasyonun konumuna bağlıdır. Protein yapısı için, bu etkinin önemli bir belirleyicisi, kodlanan molekülün yapısıdır. Burada, protein yapısının sekans evrimine etkisine ilişkin bazı içgörüler sunacağım: (1) adaptif mutasyonların 3D protein yapıları boyunca dağılımı ve (2) protein yapısının pozisyonlar arasındaki eş-evrim oluşturması. İki istatistiksel yaklaşım sunacağım: mutasyonların uyumluluk etkilerinin dağılımını modelleyerek adaptif eş anlamlı olmayan substitüsyon hızını çıkarmaya olanak tanıyan McDonald-Kreitman yaklaşımının bir uzantısı ve eş-evrilen pozisyonları çıkarmak için kullanılan bir substitüsyon haritalama prosedürü.
Tarih: 4 Eylül, 2020 – 6:00 pm (GMT+3)
Dil: İngilizce