Webinar Hakkında
Sunucu
Ercüment Çiçek
Bilkent Üniversitesi bilgisayar mühendisliği bölümünde yardımcı doçentim. Carnegie Mellon Üniversitesi Bilgisayar Bilimi Okulu hesaplamalı biyoloji bölümünde yardımcı öğretim üyesiyim. Carnegie Mellon Üniversitesi’nde hesaplamalı biyoloji alanında lane bursiyeri olarak görev yaptım. Danışmanlarım Kathryn Roeder ve Ziv Bar-Joseph’tir. 2013 yılında Case Western Reserve Üniversitesi’nden bilgisayar bilimi alanında doktoramı aldım. Danışmanım Gultekin Ozsoyoglu’ydu.
Özet
Yeni Nesil Dizileme teknolojileri birçok değişken açısından birbirinden farklılık göstermektedir. Kısa fragment dizileme veya uzun fragment dizileme teknolojileri arasında bir seçim yapmak, doğruluk oranı veya fragmentlerin uzunluğu arasında bir tercih yapmayı gerektirir. Bu çalışmada benzersiz bir algoritma olan Hercules’i geliştirdik. Hercules, uzun fragmentlerdeki hataları düzeltmek için makine öğrenimi tekniği kullanan ilk algoritmadır. Araştırmacılar genellikle uzun parçalardaki hataları kısa parçalarla düzeltir. Mevcut grafik yapısı ve hizalamaya dayalı düzeltme yöntemleri, dizileme teknolojisinin hata profilini görmezden gelmektedir. Hata profilini ele alan ve hafıza ve zaman açısından verimli olan makine öğrenimi teknikleri, hataları daha iyi düzeltme ve her iki teknolojiyi daha iyi birleştirme potansiyeline sahiptir.
Tarih: 23 Mayıs 2019 – 17:00
Dil: Türkçe